Тип организационе структуре коју компанија изабере ће утицати на односе са запосленима, услуге корисницима и пословне односе. Сврха органске организационе структуре је да обезбеди флексибилност за промене које могу да иницирају запослени. Раван организациони модел који ограничава количину хијерархије у организацији, изграђен је око мисли, потреба и повратних информација запослених или радника. Иако органска организациона структура подстиче демократију на радном мјесту, она има недостатке које треба размотрити.
Нема границе
Чланови организације дефинишу органске границе организационе структуре. То значи да се правила, границе и стандарди могу стално мијењати овисно о утјецају чланова тима. Ово може добро функционисати у неким организацијама, али може довести до похлепе и себичних мотива умјесто корпоративне одговорности. Недостатак граница може такође утицати на односе са купцима ако се клијенту дају различити одговори на исто питање.
Непродуктивне директиве
Када руководство даје директиве, те директиве могу постати непродуктивне због недостатка мотивације. На примјер, ако је органска организациона структура имплементирана у локалној агенцији за проведбу закона, потреба за хитним и непосредним смјером не би постојала. У овој ситуацији, потребна је ауторитативнија организациона структура у којој подређени одмах реагују на налоге.
Неефикасно лидерство
Ако моћ лежи у рукама запосленог, то може довести до неефикасног руковођења. На пример, ако су запослени навикли да управљају самим собом и онда лидер покушава да спроведе промене, запослени можда неће одговорити на смер јер виде себе као лидерство. Лидерство у органској организационој структури треба да остане дефинисано и активно укључено у процес доношења одлука и спровођење политике. Органска организациона структура такође може уклонити горње руководство из свакодневних послова.
Препреке комуникације
Органска организациона структура може створити комуникацијске баријере између одјела. Пошто су одељења самоуправна, може доћи до конфликта између два одељења која не виде ствари на исти начин. Друга препрека у комуникацији је недостатак дефиниције. Ако свако одељење различито дефинише различите политике, једно одељење можда неће разумети поруку коју шаље друга служба.
