Организациона структура диктира како запослени и менаџмент комуницирају унутар агенције. Као што привредни субјекти у приватном сектору користе своје организационе структуре како би остварили своје циљеве продуктивности и профитабилности, агенције у јавном сектору запошљавају организациону структуру како би испуниле своје задатке за добро свих грађана. Агенције јавног сектора се ослањају на стриктну дефиницију улога унутар организационе структуре да би извршиле своје мисије.
Вертикална структура
Већина владиних агенција на свим нивоима користи вертикалну структуру.Вертикалне организационе структуре дефинисане су тиме што на врху има директора или директора одељења, са великим бројем средњих менаџера и још нижим позицијама. Шефови одељења диктирају оперативне процедуре, средњи руководиоци креирају планове за спровођење тих процедура, а радници на нижем нивоу извршавају потребне задатке. Док су разне гране војне службе главни примери вертикалне структуре, многе цивилне агенције такође користе овај метод.
Хоризонтална структура
Док се вертикална структура фокусира на хијерархију, хоризонтална структура користи једнаку поставку. Хоризонтална структура користи мање слојева између управљања и рада и омогућава отворенију комуникацију између тих слојева. Иако се ретко виђа на највишим нивоима власти, хоризонтална структура се често користи у агенцијама са мањим јурисдикцијама, нижим буџетима и мање запослених. На пример, директор локалног одељења за здравство може да користи хоризонталну структуру да комуницира директно са инспекторима и другим запосленима, уместо да користи средњег менаџера.
Дивисионал Струцтуре
Структуре дивизија одвајају запослене по занимању или географији. Свако одељење надгледа сопствене операције уз минималан допринос других одељења. На примјер, на савезном нивоу, Стејт департмент води вањске послове. У оквиру Стејт департмента постоје одељења која се баве пословима везаним за економски раст, политичке послове, контролу оружја и људска права.
Матрик Струцтуре
Матрица организационе структуре користи систем у коме се односи између запослених и менаџмента успостављају као мрежа - или матрица - уместо у конвенционалној хијерархији. Структура матрице омогућава агенцијама да се преклапају дужности да комуницирају једна са другом, али то такође може довести до дуплицирања напора. На примјер, Управа за науку и технологију, одјел Одјела за домовинску сигурност, користи структуру матрице за координацију својих напора у борби против тероризма.
